Breeder Archives - Zoolyx

Kan een ISAG 2006 omgezet worden in een ISAG 2020 profiel?

Tom Nagels — Wed, 04 Dec 2024 13:09:14 +0000

Neen, beide profielen zijn op een totaal verschillende technologie gebaseerd.

Voor afstamming kunnen ISAG 2006 profielen enkel vergeleken worden met andere ISAG 2006 profielen en ISAG 2020 profielen enkel met ISAG 2020 profielen.

Bovendien aanvaardt Zoolyx, VHL en Certagen voor afstammingscontrole enkele ISAG 2020 profielen uitgegeven door één van deze drie laboratoria.

Pup	Ouders	Afstammingscontrole
ISAG 2006	ISAG 2006 (Elk labo)	Mogelijk
ISAG 2006	ISAG 2020 (Elk Labo)	Niet mogelijk, bestel voor de pup H3209 ISAG 2020
ISAG 2020 (Zoolyx/VHL/Certagen)	ISAG 2020 (Zoolyx/VHL/Certagen)	Mogelijk
ISAG 2020 (Zoolyx/VHL/Certagen)	ISAG 2020 (Ander labo)	Niet mogelijk, bestel voor de ouders H3200 ISAG 2020
ISAG 2020 (Zoolyx/VHL/Certagen)	ISAG 2006 (Elk labo)	Niet mogelijk, bestel voor de ouders H3200 ISAG 2020
Geen	ISAG 2006 (Elk labo)	Bestel voor de pup H3201 ISAG 2006 of H3204 ISAG 2006+2020 indien toekomstig fokdier
Geen	ISAG 2020 (Zoolyx/VHL/Certagen)	Bestel voor de pup H3209 ISAG 2020
Geen	ISAG 2020 (Ander labo)	Bestel voor de pup H3209 ISAG 2020 voor de ouders H3200 ISAG 2020
Geen	Geen	Bestel voor de pup H3209 ISAG 2020 voor de ouders H3200 ISAG 2020

The post Kan een ISAG 2006 omgezet worden in een ISAG 2020 profiel? appeared first on Zoolyx.

Wat is het verschil tussen ISAG 2006 en 2020?

Tom Nagels — Wed, 04 Dec 2024 11:52:29 +0000

ISAG 2006 STR

Deze set maakt gebruik van 21 STR (Short Tandem Repeats) merkers, korte stukjes DNA die herhaald worden en waarvan de totale lengte van individu tot individu kunnen verschillen.

Beperkingen

Beperkte genetische informatie: Met slechts 21 markers is de toepassing slechts beperkt tot het vaststellen van vader/moeder/ouderschap.
“Probleem” afstammingen: In sommige gevallen is toch een DNA-profiel van de moeder nodig om het vaderschap te bevestigen.

ISAG 2020 SNP

Deze set maakt gebruik van 230 SNP (Single Nucleotide Polymorphism) merkers, enkelvoudige nucleotiden op welbepaalde plaatsen in het genoom verspreid over alle chromosomen die van individu tot individu kunnen verschillen.

Voordelen

Hogere resolutie: Gezien het grotere aantal markers bieden SNP’s een uitgebreider genetisch profiel.
Stabieler: SNP’s ondergaan over het algemeen minder spontane mutaties dan STR’s en geven dus consistentere resultaten.
Bredere toepassing: SNP’s kunnen naast afstamming gebruikt worden voor rasidentificatie, broer/zus-verificatie en het berekenen van heterozygositeit en inteeltcoëfficient.

The post Wat is het verschil tussen ISAG 2006 en 2020? appeared first on Zoolyx.

Zijn de afnameinstructies beschikbaar in het Engels?

Tom Nagels — Mon, 11 Mar 2019 21:37:10 +0000

Ja. U kan ze hier downloaden.

Download

The post Zijn de afnameinstructies beschikbaar in het Engels? appeared first on Zoolyx.

Wat is een geldig ISAG DNA-profiel (hond)?

Tom Nagels — Fri, 24 Aug 2018 09:48:48 +0000

De International Society for Animal Genetics, kortweg ISAG, legt de methode en genetische merkerset vast die internationaal toegepast wordt om de afstamming van dieren na te gaan.

Voor honden zijn er ondertussen twee systemen in voege: ISAG 2006 en ISAG 2020. Deze zijn onderling NIET uitwisselbaar. ISAG 2006 zal met de tijd uitgefaseerd worden.

ISAG 2006

Deze set maakt gebruik van 21 STR (Short Tandem Repeats) merkers, korte stukjes DNA die herhaald worden en waarvan de totale lengte van individu tot individu kunnen verschillen.

AHT121	INRA21
AHT137	INU005
AHTh130	INU030
AHTh171	INU055
AHTh260	REN105L03
AHTk211	REN162C04
AHTk253	REN169D01
AMELOGENIN (*)	REN169O18
CXX279	REN54P11
(FH2054) (**)	REN64E19
FH2848	REN247M23

(*) geslachtsmerker

(**) werd geschrapt sinds eind 2017, en wordt niet langer rekening mee gehouden.

Een geldig ISAG 2006 profiel

is goed leesbaar, alle getallen moeten ondubbelzinnig leesbaar zijn;
omschrijft de allelen van de merkers onder de vorm van een getal (bvb 220/224). De AMELOGENIN merker kan gerapporteerd zijn als X/X of X/Y (of Y/X);
bevat 22 (incl. FH2054) of 21 merkers (excl. FH2054) bestaat, minstens 20 merkers met resultaat (excl. FH2054).

ISAG 2020

Deze set maakt gebruik van 230 SNP (Single Nucleotide Polymorphism) merkers, enkelvoudige nucleotiden op welbepaalde plaatsen in het genoom verspreid over alle chromosomen die van individu tot individu kunnen verschillen.

De set bestaat uit twee panels, een standaardpanel waarvan de merkers getoond in onderstaande tabel en een uitbreidingspanel (niet getoond) dat gebruikt wordt voor afstamming wanneer het standaardpanel onvoldoende zekerheid biedt en voor berekening van genetische variatie en inteeltcoëfficienten.

Het resultaat van elke merker is het nucleotide (A,T,C of G) dat aangetroffen werd op het ene en op het andere chromosoom. Bvb A/G.

AH0JFQR	BICF2G630111735	BICF2P1159837	BICF2P65087	BICF2S23648905
AH0JFQS	BICF2G630122583	BICF2P1192522	BICF2P728698	BICF2S23713161
AH1SDW1	BICF2G630133028	BICF2P1216677	BICF2P774003	BICF2S23737033
AH1SDWZ	BICF2G630149030	BICF2P1226745	BICF2P805553	G1425f16S28
AH3999C	BICF2G630159183	BICF2P1308802	BICF2P878175	P14
AH704R2	BICF2G630200354	BICF2P1344095	BICF2P885380	P24
AH892YB	BICF2G630209373	BICF2P1346673	BICF2P935470	P27
AHBKGAB	BICF2G630220326	BICF2P1357746	BICF2P990814	P30
AHBKGAE	BICF2G630271966	BICF2P1454500	BICF2P998036	P37
AHCTEGK	BICF2G630276039	BICF2P157421	BICF2S22943825	P41
AHD2CMU	BICF2G630326688	BICF2P182473	BICF2S23018785	P54
AHFBAS1	BICF2G630409193	BICF2P237994	BICF2S23049416	P55
AHGJ8ZA	BICF2G630437783	BICF2P251850	BICF2S23111132	P65
AHHS65F	BICF2G630552597	BICF2P277987	BICF2S23124313	P73
AHKA3HV	BICF2G630558437	BICF2P347679	BICF2S23126079	P80
AHMSZUB	BICF2G630594648	BICF2P382742	BICF2S23214514	P87
AHPAV6S	BICF2G630634836	BICF2P516667	BICF2S23246455	P88
AHPAV6U	BICF2G630653298	BICF2P554817	BICF2S23326150	TIGRP2P316532_rs8597522
AHRSSI9	BICF2G630689403	BICF2P561057	BICF2S23329382	TIGRP2P356245_rs8830240
AHUAOVN	BICF2G630708384	BICF2P600196	BICF2S2338108	TIGRP2P362535_rs9130694
AHVJM1W	BICF2G630798972	BICF2P615597	BICF2S23449478	TIGRP2P372104_rs9153277
Amelogenin	BICF2P1010945	BICF2P624936	BICF2S23535154	TIGRP2P407751_rs8803124
BICF2G630102146	BICF2P105070	BICF2P635478	BICF2S236196

Voor afstammingscontrole aanvaarden Zoolyx, VHL of Certagen enkel ISAG 2020 profielen uitgegeven door één van deze drie laboratoria.

The post Wat is een geldig ISAG DNA-profiel (hond)? appeared first on Zoolyx.

Hoe lang duurt de analyse voor afstammingscontrole?

Tom Nagels — Wed, 29 Aug 2018 06:22:46 +0000

2 weken, indien een geldig ISAG profiel beschikbaar is van beide ouderdieren.

De procedure kan langer in beslag nemen wanneer

een profiel ontbreekt van één of beide ouders;
actie: u krijgt een email met het verzoek een geldig ISAG profiel in te zenden.
het monster van één of meerdere dieren ontoereikend blijkt;
actie: u krijgt een nieuwe afnamekit toegestuurd met het verzoek een nieuw monster te nemen van de betreffende dieren. Indien ook het nieuwe monster ontoereikend blijkt zal verzocht worden een EDTA bloedstaal af te nemen. Hiervoor wordt geen kit verstuurd; alle benodigdheden behoren tot de standaarduitrusting van uw dierenarts.

The post Hoe lang duurt de analyse voor afstammingscontrole? appeared first on Zoolyx.

Ouderdier overleden, geen profiel beschikbaar. Wat nu?

Tom Nagels — Sun, 30 Sep 2018 17:50:13 +0000

Indien een ouderdier overleden is zonder dat eerder een ISAG compatibel DNAprofiel werd opgesteld, zijn er twee mogelijkheden.

Er is nog monstermateriaal beschikbaar.

Het DNAprofiel kan opgesteld worden aan de hand van (diepvries)sperma of een weefselbiopt.

Borstels, speeltjes, halsbanden en andere attributen waarmee het overleden dier intiem mee in contact is geweest, evenals gestold bloed of urine KUNNEN NIET. De analysemethode is geoptimaliseerd voor zuivere monstertypes. Gecontamineerde (onzuiver) monsters vergen forensische onderzoekstechnieken die vele malen duurder zijn zonder enige garantie op resultaat.

Er is geen monstermateriaal beschikbaar.

Indien het lichaam (of sperma) niet meer beschikbaar is kan het profiel gereconstrueerd worden aan de hand van

het profiel van BEIDE ouders van het overleden dier
plus een nest waarvan het overleden dier ouder wordt geacht te zijn

Een gereconstrueerd profiel is niet altijd volledig en bevat een aantal onzekerheden. Hoe meer afstammelingen (pups) in de reconstructie betrokken worden, hoe correcter en hoe groter de zekerheid van afstamming.

The post Ouderdier overleden, geen profiel beschikbaar. Wat nu? appeared first on Zoolyx.

Welke regels worden gevolgd voor het controleren van de afstamming?

Tom Nagels — Wed, 29 Aug 2018 09:53:18 +0000

De afstamming wordt geaccepteerd en gerapporteerd als JJJ indien in de 21 onderzochte merkers van de nakomeling de volgende situaties voorkomen:

een sluitende afstamming: voor alle merkers wordt het ene allel van de nakomeling teruggevonden bij de vader en het ander bij de moeder.

vb. sluitende afstamming
één mismatch is toegestaan: één allel van één merker wordt niet teruggevonden bij één van de ouders.

vb. afstamming met 1 mismatch tov vader

Wanneer twee of meerdere markers fout gaan, wordt de afstamming afgekeurd waarbij

JN = vader kan niet uitgesloten worden, moeder is uitgesloten

vb. 4 merkers falen tov moeder
NJ = vader is uitgesloten, moeder kan niet uitgesloten worden
NN = vader en moeder zijn uitgesloten

In geval geen andere ouder(s) in aanmerking komen, kan het profiel van het vermeende ouderdier opnieuw opgesteld worden via een nieuwe staalname om fouten in zijn aanvankelijk profiel uit te sluiten.

Belangrijk: de afstamming wordt voor gans het nest bekeken. Zolang één van de pups niet kwalificeert wordt ook de pedigree van de andere pups die eventueel wel kwalificeren niet vrijgegeven.

The post Welke regels worden gevolgd voor het controleren van de afstamming? appeared first on Zoolyx.

De afstamming van mijn pups/kittens klopt niet. Wat nu?

Tom Nagels — Thu, 30 Aug 2018 16:34:27 +0000

Om afstamming te bewijzen moet aan bepaalde regels voldaan zijn.

De meest voorkomende oorzaken van een (voorlopige) afkeuring zijn:

werkelijk een andere vader of een dubbele dekking (sommige rassen zijn hiervoor notoir)
fout in twee of meer merkers van het profiel van één of beide ouders
verkeerde ouder(s) opgegeven tijdens nestaangifte
profiel van één of beide ouders is niet ISAG compatiebel
in geval van gelijktijdige nesten, pups/kittens die in een andere nest gekropen zijn
in geval van afname van meerdere nesten tegelijk, verwisseling van pups/kittens van het ene nest met een ander

The post De afstamming van mijn pups/kittens klopt niet. Wat nu? appeared first on Zoolyx.

Het geslacht op het afstammingscertificaat klopt niet (hond). Hoe kan dat?

Tom Nagels — Thu, 30 Aug 2018 07:43:24 +0000

Bij de hond wordt het geslacht op het certificaat bepaald door de AMELOGENIN merker.

Geslacht	STR, letternotatie	STR, cijfernotatie	SNP
Mannelijk	X/Y of Y/X	182/217	A/G
Vrouwelijk	X/X	217/217	G/G

Er word geen rekening gehouden met het geslacht dat doorgegeven werd bij de aanvraag. Het DNA aanwezig in de tube enerzijds en het chipnummer (of andere identificatie) op dezelfde tube anderzijds zijn onlosmakelijk met elkaar verbonden. Wanneer het afwijkt van het echte geslacht kan er zich tijdens staalname of staalontvangst een staalverwisseling voorgedaan.

En nu?

Eerst kijken we de ruwe analysegegevens opnieuw na om na te gaan of het piekenpatroon niet verkeerd werd geïnterpreteerd. Indien het geval wordt dit uiteraard zonder meerkosten rechtgezet.

In geval van verwisseling is niet alleen het geslacht verkeerd maar het ganse profiel. Het verkeerde dier werd immers aan de verkeerde tube gekoppeld. Wij kijken de identificatie van de originele tubes na en de stalen worden opnieuw geanalyseerd. Er zijn dan twee mogelijkheden.

1. Uit de heranalyse komt een ander profiel (en geslacht). De vergissing heeft zich voorgedaan bij staalontvangst. De fout wordt rechtgezet zonder meerkosten.
2. Uit de heranalyse komt hetzelfde profiel (en dus geslacht). De vergissing heeft zich bij staalname voorgedaan. De fout kan niet rechtgezet worden zonder een nieuwe staalname op eigen kosten.

The post Het geslacht op het afstammingscertificaat klopt niet (hond). Hoe kan dat? appeared first on Zoolyx.

Wie kan een analyseverslag opvragen?

Admin Crmart — Tue, 08 Nov 2016 12:48:49 +0000

Omwille van privacy en deontologie worden analyserapporten enkel bezorgd aan:

de aanvragende dierenarts of inzender van de monsters
de eigenaar van het dier op het moment van de aanvraag
eventuele cc emailadressen op het moment van de aanvraag

Een derde niet betrokken bij de oorspronkelijke aanvraag kan geen resultaat rechtstreeks bij ons opvragen, wel via de oorspronkelijke dierenarts of eigenaar.

Wij behouden ons het recht voor om voorafgaandelijk betaling van de uitgevoerde of uit te voeren analyses te vragen.

The post Wie kan een analyseverslag opvragen? appeared first on Zoolyx.