Les deux techniques utilisent des primers qui détectent un morceau de code génétique caractéristique de ce que l’on recherche dans l’échantillon. La différence avec RT-qPCR est l’utilisation supplémentaire d’une sonde (probe) fluorescente. Cette sonde, également caractéristique pour le code recherché, se lie un peu loin des primers.
La pièce manquante entre les primers et la sonde est complétée par la polymérase Taq. Au moment où la chaîne est entièrement copiée, la sonde libère son label fluorescente.
À la fin du cycle, une copie est produite qui est utilisée ensemble avec l’original dans le cycle suivant pour les copier à nouveau. Comme le nombre de copies double au cours de cycles successifs, la fluorescence augmente de façon exponentielle.
Cependant, à mesure que les cycles progressent, les réactifs sont épuisés et constituent un facteur limitant pour l’augmentation exponentielle, l’augmentation de la fluorescence ralentit et cela de plus en plus rapide.
R&ndy l’explique aussi en détail dans ce film.