FR
Facebook
T. +32 (0)53 72 90 20 nl | +32 (0)53 72 90 28 fr|info@zoolyx.be
Dierenartsen Eigenaars Fokkers

DNAprofiel SNP (ISAG 2020) + Ouderschap Hond

DNAprofiel SNP (ISAG 2020) + Ouderschap Hond

Bestel het onderzoek

56,87
47,00 (excl. 21% BTW)

Omschrijving

DNAfingerprint volgens de ISAG 2020 standaard. Met deze nieuwe standaard worden meer dan 200 SNP markers in kaart gebracht (itt slechts 22 met de oude ISAG 2006) waarmee niet alleen met een grotere zekerheid ouderschap kan bevestigd worden maar ook heterozygositeit (genetische diversiteit) en een inteeltcoëfficient (graad van verwantschap) kan berekend worden. Twee belangrijke parameters om de genetische gezondheid van een populatie op peil te houden.

Opgelet: de op SNP gebaseerde ISAG 2020 standaard is niet compatibel met de oudere op STR gebaseerde ISAG 2006 standaard. Alle dieren betrokken in een verwantschapsonderzoek dienen over eenzelfde type te beschikken.

Doeldiersoort en rassen

Hond

Elk ras

Staalname

  • Wisser genetisch
  • EDTA volbloed

Doorlooptijd

14 dagen

Rubriek

Genetische profielen

Code

H3209

Analyses

1 DNAprofiel SNP (ISAG 2020)
1-1 Afstamming (1)

Kan een ISAG 2006 omgezet worden in een ISAG 2020 profiel?2024-12-04T14:09:14+01:00

Neen, beide profielen zijn op een totaal verschillende technologie gebaseerd.

Voor afstamming kunnen ISAG 2006 profielen enkel vergeleken worden met andere ISAG 2006 profielen en ISAG 2020 profielen enkel met ISAG 2020 profielen.

Bovendien aanvaardt Zoolyx, VHL en Certagen voor afstammingscontrole enkele ISAG 2020 profielen uitgegeven door één van deze drie laboratoria.

Pup Ouders Afstammingscontrole
ISAG 2006 ISAG 2006 (Elk labo) Mogelijk
ISAG 2006 ISAG 2020 (Elk Labo) Niet mogelijk, bestel voor de pup H3209 ISAG 2020
ISAG 2020 (Zoolyx/VHL/Certagen) ISAG 2020 (Zoolyx/VHL/Certagen) Mogelijk
ISAG 2020 (Zoolyx/VHL/Certagen) ISAG 2020 (Ander labo) Niet mogelijk, bestel voor de ouders H3200 ISAG 2020
ISAG 2020 (Zoolyx/VHL/Certagen) ISAG 2006 (Elk labo) Niet mogelijk, bestel voor de ouders H3200 ISAG 2020
Geen ISAG 2006 (Elk labo) Bestel voor de pup H3201 ISAG 2006 of H3204 ISAG 2006+2020 indien toekomstig fokdier
Geen ISAG 2020 (Zoolyx/VHL/Certagen) Bestel voor de pup H3209 ISAG 2020
Geen ISAG 2020 (Ander labo) Bestel voor de pup H3209 ISAG 2020 voor de ouders H3200 ISAG 2020
Geen Geen  Bestel voor de pup H3209 ISAG 2020 voor de ouders H3200 ISAG 2020
Wat is het verschil tussen ISAG 2006 en 2020?2024-12-04T12:55:01+01:00

ISAG 2006 STR

Deze set maakt gebruik van 21 STR (Short Tandem Repeats) merkers, korte stukjes DNA die herhaald worden en waarvan de totale lengte van individu tot individu kunnen verschillen.

Beperkingen

  1. Beperkte genetische informatie: Met slechts 21 markers is de toepassing slechts beperkt tot het vaststellen van vader/moeder/ouderschap.
  2. “Probleem” afstammingen: In sommige gevallen is toch een DNA-profiel van de moeder nodig om het vaderschap te bevestigen.

ISAG 2020 SNP

Deze set maakt gebruik van 230 SNP (Single Nucleotide Polymorphism) merkers, enkelvoudige nucleotiden op welbepaalde plaatsen in het genoom verspreid over alle chromosomen die van individu tot individu kunnen verschillen.

Voordelen

  1. Hogere resolutie: Gezien het grotere aantal markers bieden SNP’s een uitgebreider genetisch profiel.
  2. Stabieler: SNP’s ondergaan over het algemeen minder spontane mutaties dan STR’s en geven dus consistentere resultaten.
  3. Bredere toepassing: SNP’s kunnen naast afstamming gebruikt worden voor rasidentificatie, broer/zus-verificatie en het berekenen van heterozygositeit en inteeltcoëfficient.
Zijn de afnameinstructies beschikbaar in het Engels?2022-12-30T16:59:17+01:00

Ja. U kan ze hier downloaden.

Download
Wat is een geldig ISAG DNA-profiel (hond)?2024-12-05T16:20:50+01:00

De International Society for Animal Genetics, kortweg ISAG, legt de methode en genetische merkerset vast die internationaal toegepast wordt om de afstamming van dieren na te gaan.

Voor honden zijn er ondertussen twee systemen in voege: ISAG 2006 en ISAG 2020. Deze zijn onderling NIET uitwisselbaar. ISAG 2006 zal met de tijd uitgefaseerd worden.

ISAG 2006

Deze set maakt gebruik van 21 STR (Short Tandem Repeats) merkers, korte stukjes DNA die herhaald worden en waarvan de totale lengte van individu tot individu kunnen verschillen.

AHT121 INRA21
AHT137 INU005
AHTh130 INU030
AHTh171 INU055
AHTh260 REN105L03
AHTk211 REN162C04
AHTk253 REN169D01
AMELOGENIN (*) REN169O18
CXX279 REN54P11
(FH2054) (**) REN64E19
FH2848 REN247M23
(*) geslachtsmerker

(**) werd geschrapt sinds eind 2017, en wordt niet langer rekening mee gehouden.

Een geldig ISAG 2006 profiel

  • is goed leesbaar, alle getallen moeten ondubbelzinnig leesbaar zijn;
  • omschrijft de allelen van de merkers onder de vorm van een getal (bvb 220/224). De AMELOGENIN merker kan gerapporteerd zijn als X/X of X/Y (of Y/X);
  • bevat 22 (incl. FH2054) of 21 merkers (excl. FH2054) bestaat, minstens 20 merkers met resultaat (excl. FH2054).

ISAG 2020

Deze set maakt gebruik van 230 SNP (Single Nucleotide Polymorphism) merkers, enkelvoudige nucleotiden op welbepaalde plaatsen in het genoom verspreid over alle chromosomen die van individu tot individu kunnen verschillen.

De set bestaat uit twee panels, een standaardpanel waarvan de merkers getoond in onderstaande tabel en een uitbreidingspanel (niet getoond) dat gebruikt wordt voor afstamming wanneer het standaardpanel onvoldoende zekerheid biedt en voor berekening van genetische variatie en inteeltcoëfficienten.

Het resultaat van elke merker is het nucleotide (A,T,C of G) dat aangetroffen werd op het ene en op het andere chromosoom. Bvb A/G.

AH0JFQR BICF2G630111735 BICF2P1159837 BICF2P65087 BICF2S23648905
AH0JFQS BICF2G630122583 BICF2P1192522 BICF2P728698 BICF2S23713161
AH1SDW1 BICF2G630133028 BICF2P1216677 BICF2P774003 BICF2S23737033
AH1SDWZ BICF2G630149030 BICF2P1226745 BICF2P805553 G1425f16S28
AH3999C BICF2G630159183 BICF2P1308802 BICF2P878175 P14
AH704R2 BICF2G630200354 BICF2P1344095 BICF2P885380 P24
AH892YB BICF2G630209373 BICF2P1346673 BICF2P935470 P27
AHBKGAB BICF2G630220326 BICF2P1357746 BICF2P990814 P30
AHBKGAE BICF2G630271966 BICF2P1454500 BICF2P998036 P37
AHCTEGK BICF2G630276039 BICF2P157421 BICF2S22943825 P41
AHD2CMU BICF2G630326688 BICF2P182473 BICF2S23018785 P54
AHFBAS1 BICF2G630409193 BICF2P237994 BICF2S23049416 P55
AHGJ8ZA BICF2G630437783 BICF2P251850 BICF2S23111132 P65
AHHS65F BICF2G630552597 BICF2P277987 BICF2S23124313 P73
AHKA3HV BICF2G630558437 BICF2P347679 BICF2S23126079 P80
AHMSZUB BICF2G630594648 BICF2P382742 BICF2S23214514 P87
AHPAV6S BICF2G630634836 BICF2P516667 BICF2S23246455 P88
AHPAV6U BICF2G630653298 BICF2P554817 BICF2S23326150 TIGRP2P316532_rs8597522
AHRSSI9 BICF2G630689403 BICF2P561057 BICF2S23329382 TIGRP2P356245_rs8830240
AHUAOVN BICF2G630708384 BICF2P600196 BICF2S2338108 TIGRP2P362535_rs9130694
AHVJM1W BICF2G630798972 BICF2P615597 BICF2S23449478 TIGRP2P372104_rs9153277
Amelogenin BICF2P1010945 BICF2P624936 BICF2S23535154 TIGRP2P407751_rs8803124
BICF2G630102146 BICF2P105070 BICF2P635478 BICF2S236196
Hoe lang duurt de analyse voor afstammingscontrole?2022-12-30T16:57:37+01:00

2 weken, indien een geldig ISAG profiel beschikbaar is van beide ouderdieren.

De procedure kan langer in beslag nemen wanneer

  • een profiel ontbreekt van één of beide ouders;
    actie: u krijgt een email met het verzoek een geldig ISAG profiel in te zenden.
  • het monster van één of meerdere dieren ontoereikend blijkt;
    actie: u krijgt een nieuwe afnamekit toegestuurd met het verzoek een nieuw monster te nemen van de betreffende dieren. Indien ook het nieuwe monster ontoereikend blijkt zal verzocht worden een EDTA bloedstaal af te nemen. Hiervoor wordt geen kit verstuurd; alle benodigdheden behoren tot de standaarduitrusting van uw dierenarts.
Ouderdier overleden, geen profiel beschikbaar. Wat nu?2022-12-30T16:57:43+01:00

Indien een ouderdier overleden is zonder dat eerder een ISAG compatibel DNAprofiel werd opgesteld, zijn er twee mogelijkheden.

Er is nog monstermateriaal beschikbaar.

Het DNAprofiel kan opgesteld worden aan de hand van (diepvries)sperma of een weefselbiopt.

Borstels, speeltjes, halsbanden en andere attributen waarmee het overleden dier intiem mee in contact is geweest, evenals gestold bloed of urine KUNNEN NIET. De analysemethode is geoptimaliseerd voor zuivere monstertypes. Gecontamineerde (onzuiver) monsters vergen forensische onderzoekstechnieken die vele malen duurder zijn zonder enige garantie op resultaat.

Er is geen monstermateriaal beschikbaar.

Indien het lichaam (of sperma) niet meer beschikbaar is kan het profiel gereconstrueerd worden aan de hand van

  • het profiel van BEIDE ouders van het overleden dier
  • plus een nest waarvan het overleden dier ouder wordt geacht te zijn

Een gereconstrueerd profiel is niet altijd volledig en bevat een aantal onzekerheden. Hoe meer afstammelingen (pups) in de reconstructie betrokken worden, hoe correcter en hoe groter de zekerheid van afstamming.

Welke regels worden gevolgd voor het controleren van de afstamming?2022-12-30T16:57:49+01:00

De afstamming wordt geaccepteerd en gerapporteerd als JJJ indien in de 21 onderzochte merkers van de nakomeling de volgende situaties voorkomen:

  1. een sluitende afstamming: voor alle merkers wordt het ene allel van de nakomeling teruggevonden bij de vader en het ander bij de moeder.

    vb. sluitende afstamming
  2. één mismatch is toegestaan: één allel van één merker wordt niet teruggevonden bij één van de ouders.

    vb. afstamming met 1 mismatch tov vader

 

Wanneer twee of meerdere markers fout gaan, wordt de afstamming afgekeurd waarbij

  1. JN = vader kan niet uitgesloten worden, moeder is uitgesloten

    vb. 4 merkers falen tov moeder
  2. NJ = vader is uitgesloten, moeder kan niet uitgesloten worden
  3. NN = vader en moeder zijn uitgesloten

In geval geen andere ouder(s) in aanmerking komen, kan het profiel van het vermeende ouderdier opnieuw opgesteld worden via een nieuwe staalname om fouten in zijn aanvankelijk profiel uit te sluiten.

Belangrijk: de afstamming wordt voor gans het nest bekeken. Zolang één van de pups niet kwalificeert wordt ook de pedigree van de andere pups die eventueel wel kwalificeren niet vrijgegeven.

 

De afstamming van mijn pups/kittens klopt niet. Wat nu?2024-12-11T09:22:03+01:00

Om afstamming te bewijzen moet aan bepaalde regels voldaan zijn.

De meest voorkomende oorzaken van een (voorlopige) afkeuring zijn:

  • werkelijk een andere vader of een dubbele dekking (sommige rassen zijn hiervoor notoir)
  • fout in twee of meer merkers van het profiel van één of beide ouders
  • verkeerde ouder(s) opgegeven tijdens nestaangifte
  • profiel van één of beide ouders is niet ISAG compatiebel
  • in geval van gelijktijdige nesten, pups/kittens die in een andere nest gekropen zijn
  • in geval van afname van meerdere nesten tegelijk, verwisseling van pups/kittens van het ene nest met een ander
Het geslacht op het afstammingscertificaat klopt niet (hond). Hoe kan dat?2024-12-11T10:46:59+01:00

Bij de hond wordt het geslacht op het certificaat bepaald door de AMELOGENIN merker.

Geslacht STR, letternotatie STR, cijfernotatie SNP
Mannelijk X/Y of Y/X 182/217 A/G
Vrouwelijk X/X 217/217 G/G

Er word geen rekening gehouden met het geslacht dat doorgegeven werd bij de aanvraag. Het DNA aanwezig in de tube enerzijds en het chipnummer (of andere identificatie) op dezelfde tube anderzijds zijn onlosmakelijk met elkaar verbonden. Wanneer het afwijkt van het echte geslacht kan er zich tijdens staalname of staalontvangst een staalverwisseling voorgedaan.

En nu?

Eerst kijken we de ruwe analysegegevens opnieuw na om na te gaan of het piekenpatroon niet verkeerd werd geïnterpreteerd. Indien het geval wordt dit uiteraard zonder meerkosten rechtgezet.

In geval van verwisseling is niet alleen het geslacht verkeerd maar het ganse profiel. Het verkeerde dier werd immers aan de verkeerde tube gekoppeld. Wij kijken de identificatie van de originele tubes na en de stalen worden opnieuw geanalyseerd. Er zijn dan twee mogelijkheden.

    1. Uit de heranalyse komt een ander profiel (en geslacht). De vergissing heeft zich voorgedaan bij staalontvangst. De fout wordt rechtgezet zonder meerkosten.
    2. Uit de heranalyse komt hetzelfde profiel (en dus geslacht). De vergissing heeft zich bij staalname voorgedaan. De fout kan niet rechtgezet worden zonder een nieuwe staalname op eigen kosten.

Links

Meer Lezen?

Login
Registreer

CONTACT

Adres

  • Groeneweg 17, B-9320 Aalst

  • ma-vrij: 8u-18u30 en za: 8u-16u

Deze website maakt gebruik van cookies om uw ervaring te verbeteren. Lees meer Cookies accepteren